Pracovně píšu emaily pořád a nejčastěji používám "Dobrý den" a stejně tak mi s tímto oslovením emaily chodí. Někdy dle situace "Vážený pane/paní... " ale to spíš když je to na takové hodně oficiální úrovni, vlastně asi spíš v přiloženém dopise. V emaile stejně zase bývá Dobrý den, v příloze zasíláme bla bla

O tom že by se to už nepoužívalo nevím a zjevně nikdo se spousty firem po celé republice.

V popsané situaci bych bez přemýšlení napsala Dobrý den.
"Zdravím" je spíš takové neuctivé, familiérní. Tak asi pro ty puberťáky. Asi to tak odpovídá výrazu "Dobrej".

Konec emailu je běžný standart "S pozdravem", případně "Přeji pěkný zbytek dne" či tak něco.